在温室中湿度大的环境条件下，该病的发病率高，轻病地病株率5～10%，一般达20～30%，重病地在50%以上。症状植株茎基部在土表上下2～3公分处出现水渍状暗绿色病斑，根系的须根和次生根出现水渍状淡褐色腐烂，不长新根，随后发展到主根和根茎处，出现淡褐色表皮，纵剖根茎维管束为浅褐色至褐色病变，地上部植株顶部叶片萎焉，重病株可扩展到全株萎焉。 
　  病菌以卵孢子或厚垣孢子随病根茬和病残体在土壤中越冬，借浇水传播蔓延，高温高湿或棚内早晚与中午温差大发病重，定植后土壤湿度大，温度高，苗期茎基腐病未能及时防治的棚地，成株期易发生根腐病，后期棚内湿度大或阴雨天多未能及时放风排湿以及管理粗放的棚地，均易发病。 
　　防治方法 
　　1、土壤消毒 
　　连作重病地定植前20～25天，可采用石灰氮(CaCN2)—太阳能土壤消毒。方法同甜椒、辣椒疫病防治方法。 
　　2、定植期用药 
　　移栽定植时可用60%百泰可分散粒剂1500倍或98%土菌消可湿性粉剂3000倍液或77%多宁可湿性粉剂600倍液或68.75%银发利悬浮剂1000倍液或50%根茎保可湿性粉剂600倍液灌根，同时还可单用诱抗剂0.5%OS-施特灵水剂500倍液或6%阿波罗963水剂1000倍液灌根，隔7～10天一次，连用2～3次。与镰孢菌根腐病混发时可喷灌60%百泰可分散粒剂1500倍液或70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液，可兼治二种病害。后期地上部发生细菌性病害时，可喷3%克菌康可湿性粉剂800倍液+50%根茎保2号可湿性粉剂800倍液，或单用OS-施特灵水剂600倍液。