红薯种入窖前必须对旧窖进行严格消毒，可用50％多菌灵600倍液或5％安索菌毒清水剂500倍液等喷洒薯窖消毒。存放红薯时，每存一层红薯，就用“红薯保险剂”稀释液均匀喷洒一遍。储藏方法大致有两种，即高温储藏法和低温储藏法。 
    1、高温储藏法：薯种入窖前，先加温18—24小时，使窖内温度达到35℃—38℃，保持四昼夜，将红薯的黑斑病、软腐病等病菌杀灭。打开天窗，排湿降温18—24小时，使窖温降至10—14℃低温进行储藏；注意观察温度变化，确保窖温稳定在12℃—13℃。