《规划》指出，南京面临着特殊环境市情。2012年，石化、电力、钢铁、水泥等产业耗煤量、耗水量、工业二氧化硫排放量、氮氧化物排放量和工业固体废物产生量占比高达90%以上。

　　《规划》明确，南京城市建设要坚持生态为基、环保优先的方针。到2015年，实现国家生态市、国家生态园林城市、国家森林城市“三城同创”。

　　《规划》设定了煤炭消费总量、镇街污水处理率、规划环境影响评价等若干特色指标。

　　根据《规划》，全市现有电力、钢铁、水泥不再新增产能，不再批准新建增加煤炭用量的项目。实施区域集中供热，关停集中供热覆盖范围内的生活和工业锅炉。关停单机容量在10万千瓦以下和设计寿命期满的30万千瓦级以下的常规煤炭火电机组。

　　《规划》提出，到2015年，煤炭消费量控制在3240万吨，煤炭消费量占一次能源消费的比重下降至40%。

　　目前，南京市城镇生活污水日处理能力达到200万吨。《规划》提出，到2015年，全市新建、扩建重点城镇生活污水处理厂28个，全市生活污水总处理能力达到270万吨/日以上，新增污水主次干管1305公里，新增片区到户支管2869公里。

　　《规划》提出，强化规划环评和项目环评的联动机制，协同实施行业产能总量控制、能耗等量替代和污染物排放总量控制。全市范围内不得新、扩建燃煤发电、钢铁、水泥、原油加工、制浆造纸项目和以煤为主要原料的项目。