为切实转变政府职能，提高行政效能，安徽省食品药品监督管理局作为省政府第一批5家行政审批权相对集中改革试点单位之一，在前期改革试点工作的基础上，2012年以来，结合食品药品监管实际，不断创新方式方法，进一步推进行政审批制度改革。

一是将原来与政策法规处合署办公（一个机构两个牌子）的局行政审批办公室独立设置，配备人员，并从各业务处室抽调人员到行政审批办公室工作，集中进驻省政务服务中心，承担食品、药品、医疗器械、保健食品、化妆品等有关行政审批工作职能。

二是制定《安徽省食品药品监督管理局深化行政审批改革试点方案》，逐步建立了行政审批办公室牵头组织协调审批工作、行政审批监督管理、规范审批流程、提升审批效能等新机制。

三是进一步整合行政审批职能，对需要现场检查、专家评审领导集体研究和上报审批的行政审批项目，实行由行政审批办公室牵头组织，各有关业务处室、各直属单位接受行政审批办委托具体办理的方式；对无需现场检查、专家评审、领导集体研究和上报审批的项目，全部纳入行政审批办公室办理。

四是积极推进处室职能调整，将各业务处室工作重心由原来的行政审批转向制订规划、研究政策、加强监管和改善服务等方面。